1937年，成立为紫金县平民医院，院址设在紫金县城西门外清宇寺旧址，即北河街1号（后为县中医院用）。

1940年，改名为“公立紫金县卫生院”。

1949年5月，更名为“紫金县卫生院”（紫金解放，由人民政府接管） 。

1950年5月，更名为“紫金县人民政府卫生院”（从清宇寺旧址迁至安良圩天主堂内，北河街保留门诊到1980年）。

1956年，命名为“紫金县人民医院”，院址迁至安良圩河唇（今县公安局址）。

1964年10月，迁院至紫城镇广场5路8号，占地面积3.5万平方米，建筑面积2万平方米。

2018年 6月，迁院至紫城镇金山大道西163号。新院筹建于2013年，占地面积9.83万平方米，建筑面积10.63万平方米。

2020年6月，挂牌紫金县医共体总医院。